НИИ «Квант» образован в 1978 году на базе Конструкторского бюро промышленной автоматики "КБПА". В настоящее время имеет статут государственного предприятия.

НИИ «Квант» является базовым научным центром отрасли по направлению «Создание высокопроизводительных систем общего и специального назначения, средств и систем защиты информации». Как ведущее предприятие, стабильно работает и развивается на протяжении более 40 лет. С момента своего создания «НИИ «Квант» активно участвовал в программе ЕС ЭВМ, создавая автоматизированные системы, отдельные аппаратные и программные средства, прошел этапы создания вычислительной аппаратуры четырех поколений: на электронных лампах, на полупроводниковых элементах, на микросхемах малой и большой интеграции.

В 1984 году НИИ «Квант» за высокие научно—технические и производственные показатели награжден орденом Трудового Красного Знамени.

Указом Президента Российской Федерации от 04.08.2004 года №1009 ФГУП «НИИ «Квант» включен в перечень стратегических предприятий страны.